
PFRMAT AL
TARGET T0119
AUTHOR 8971-8833-9593
METHOD FFAS (http://bioinformatics.burnham-inst.org/FFAS/)
METHOD Fold & Function Assignment System A profile-profile alignment method.
METHOD 1) PSI-Blast is used to collect homologs
METHOD 2) The sequences of homologs are translated into a profile
METHOD    [The translation is not based on PSI-Blast approach]
METHOD 3) Translated profile is aligned against a profile database
MODEL  3
PARENT 1NDH
REMARK DATE	1995-02-17
REMARK SCORE	?
S 98 P 3
S 99 A 4
E 100 I 5
V 101 T 6
C 102 L 7
K 103 E 8
T 104 N 9
K 105 P 10
I 106 D 11
H 107 I 12
H 108 K 13
F 109 Y 14
E 110 P 15
G 111 L 16
T 112 R 17
L 113 L 18
A 114 I 19
R 115 D 20
V 116 K 21
E 117 E 22
N 118 V 23
L 119 V 24
S 120 N 25
D 121 H 26
S 122 D 27
T 123 T 28
I 124 R 29
T 125 R 30
F 126 F 31
D 127 R 32
I 128 F 33
Q 129 A 34
L 130 L 35
D 131 P 36
D 132 S 37
G 133 P 38
Q 134 E 39
P 135 H 40
D 136 I 41
I 137 L 42
H 138 G 43
F 139 L 44
L 140 P 45
A 141 V 46
G 142 G 47
Q 143 Q 48
Y 144 H 49
V 145 I 50
N 146 Y 51
V 147 L 52
T 148 S 53
L 149 A 54
P 150 R 55
G 151 G 58
T 152 N 59
T 153 L 60
E 154 V 61
T 155 I 62
R 156 R 63
S 157 P 64
Y 158 Y 65
S 159 T 66
F 160 P 67
S 161 V 68
S 162 S 69
Q 163 S 70
P 164 D 71
G 165 D 72
N 166 D 73
R 167 G 75
L 168 F 76
T 169 V 77
G 170 D 78
F 171 L 79
V 172 V 80
V 173 I 81
R 174 K 82
N 175 V 83
V 176 Y 84
P 177 A 94
Q 178 G 95
G 179 G 96
K 180 K 97
M 181 M 98
S 182 S 99
E 183 Q 100
Y 184 Y 101
L 185 L 102
S 186 E 103
V 187 S 104
Q 188 M 105
A 189 K 106
K 190 I 107
A 191 G 108
G 192 D 109
D 193 T 110
K 194 I 111
M 195 E 112
S 196 F 113
F 197 R 114
T 198 G 115
G 199 P 116
P 200 N 117
F 201 G 118
G 202 L 119
S 203 L 120
F 204 V 121
Y 205 Y 122
L 206 Q 123
R 207 G 124
D 208 K 125
V 209 G 126
K 210 K 127
R 211 S 145
P 212 V 146
V 213 G 147
L 214 M 148
M 215 I 149
L 216 A 150
A 217 G 151
G 218 G 152
G 219 T 153
T 220 G 154
G 221 I 155
I 222 T 156
A 223 P 157
P 224 M 158
F 225 L 159
L 226 Q 160
S 227 V 161
M 228 I 162
L 229 R 163
Q 230 A 164
V 231 I 165
L 232 M 166
E 233 K 167
Q 234 D 168
K 235 P 169
G 236 D 170
S 237 H 172
E 238 T 173
H 239 V 174
P 240 C 175
V 241 H 176
R 242 L 177
L 243 L 178
V 244 F 179
F 245 A 180
G 246 N 181
V 247 Q 182
T 248 T 183
Q 249 E 184
D 250 K 185
C 251 D 186
D 252 I 187
L 253 L 188
V 254 L 189
A 255 R 190
L 256 P 191
E 257 E 192
Q 258 L 193
L 259 E 194
D 260 E 195
A 261 L 196
L 262 R 197
Q 263 N 198
Q 264 E 199
K 265 H 200
L 266 S 201
P 267 R 203
W 268 F 204
F 269 K 205
E 270 L 206
Y 271 W 207
R 272 Y 208
T 273 T 209
V 274 V 210
V 275 D 211
A 276 R 212
H 277 P 214
A 278 E 215
E 279 A 216
S 280 W 217
Q 281 D 218
H 282 Y 219
E 283 S 220
R 284 Q 221
K 285 G 222
G 286 F 223
Y 287 V 224
V 288 N 225
T 289 E 226
G 290 E 227
H 291 M 228
I 292 I 229
E 293 R 230
Y 294 D 231
D 295 H 232
W 296 L 233
L 297 P 234
N 298 P 235
G 299 E 238
G 300 E 239
E 301 P 240
V 302 L 241
D 303 V 242
V 304 L 243
Y 305 M 244
L 306 C 245
C 307 G 246
G 308 P 247
P 309 P 248
V 310 P 249
P 311 M 250
M 312 I 251
V 313 Q 252
E 314 A 254
A 315 C 255
V 316 L 256
R 317 P 257
S 318 N 258
W 319 L 259
L 320 E 260
D 321 R 261
T 322 V 262
Q 323 G 263
G 324 H 264
I 325 P 265
Q 326 K 266
P 327 E 267
A 328 R 268
N 329 C 269
F 330 F 270
L 331 A 271
TER
END

