
PFRMAT AL
TARGET T0119
AUTHOR 8971-8833-9593
METHOD FFAS (http://bioinformatics.burnham-inst.org/FFAS/)
METHOD Fold & Function Assignment System A profile-profile alignment method.
METHOD 1) PSI-Blast is used to collect homologs
METHOD 2) The sequences of homologs are translated into a profile
METHOD    [The translation is not based on PSI-Blast approach]
METHOD 3) Translated profile is aligned against a profile database
MODEL  2
PARENT 1QFJ_A
REMARK DATE	1999-05-31
REMARK SCORE	?
H 108 T 2
F 109 L 3
E 110 S 4
G 111 C 5
T 112 K 6
L 113 V 7
A 114 T 8
R 115 S 9
V 116 V 10
E 117 E 11
N 118 A 12
L 119 I 13
S 120 T 14
D 121 D 15
S 122 T 16
T 123 V 17
I 124 Y 18
T 125 R 19
F 126 V 20
D 127 R 21
I 128 I 22
Q 129 V 23
L 130 P 24
D 131 D 25
D 132 A 26
G 133 A 27
Q 134 F 28
P 135 S 29
D 136 F 30
I 137 R 31
H 138 A 32
F 139 G 33
L 140 Q 34
A 141 Y 35
G 142 L 36
Q 143 M 37
Y 144 V 38
V 145 V 39
N 146 M 40
V 147 D 41
T 148 E 42
L 149 R 43
P 150 D 44
G 151 K 45
T 152 R 46
T 153 P 47
E 154 F 48
T 155 S 49
R 156 M 50
S 157 A 51
Y 158 S 52
S 159 T 53
F 160 P 54
S 161 D 55
S 162 E 56
Q 163 G 58
P 164 F 59
G 165 I 60
N 166 E 61
R 167 L 62
L 168 H 63
T 169 I 64
G 170 G 65
P 177 Y 72
Q 178 A 73
G 179 K 74
K 180 A 75
M 181 V 76
S 182 M 77
E 183 D 78
Y 184 R 79
L 185 I 80
S 186 L 81
V 187 K 82
Q 188 D 83
A 189 H 84
K 190 Q 85
A 191 I 86
G 192 V 87
D 193 V 88
K 194 D 89
M 195 I 90
S 196 P 91
F 197 H 92
T 198 G 93
G 199 E 94
P 200 A 95
F 201 W 96
G 202 L 97
S 203 R 98
F 204 D 99
Y 205 E 101
L 206 E 102
R 207 R 103
D 208 P 104
V 209 M 105
K 210 I 106
R 211 L 107
P 212 I 108
V 213 A 109
L 214 G 110
M 215 G 111
L 216 T 112
A 217 G 113
G 218 F 114
G 219 S 115
T 220 Y 116
G 221 A 117
I 222 R 118
A 223 S 119
P 224 I 120
F 225 L 121
L 226 L 122
S 227 T 123
M 228 A 124
L 229 L 125
Q 230 A 126
V 231 R 127
L 232 N 128
E 233 P 129
Q 234 N 130
K 235 R 131
G 236 D 132
S 237 I 133
E 238 T 134
H 239 I 135
P 240 Y 136
V 241 W 137
R 242 G 138
L 243 G 139
V 244 R 140
F 245 E 141
G 246 E 142
V 247 Q 143
T 248 H 144
Q 249 L 145
D 250 Y 146
C 251 D 147
D 252 L 148
L 253 C 149
V 254 E 150
A 255 L 151
L 256 E 152
E 257 A 153
Q 258 L 154
L 259 S 155
D 260 L 156
A 261 K 157
L 262 H 158
Q 263 P 159
Q 264 G 160
K 265 L 161
L 266 Q 162
P 267 V 163
W 268 V 164
F 269 P 165
E 270 V 166
Y 271 V 167
R 272 E 168
T 273 Q 169
V 274 P 170
V 275 E 171
A 276 A 172
H 277 W 174
A 278 R 175
E 279 G 176
S 280 R 177
Q 281 T 178
H 282 G 179
E 283 T 180
R 284 V 181
K 285 L 182
G 286 T 183
Y 287 A 184
V 288 V 185
T 289 L 186
G 290 Q 187
H 291 D 188
I 292 H 189
E 293 G 190
Y 294 T 191
D 295 L 192
W 296 A 193
L 297 E 194
N 298 H 195
G 299 D 196
G 300 I 197
E 301 Y 198
V 302 I 199
D 303 A 200
V 304 G 201
Y 305 R 202
L 306 F 203
C 307 E 204
G 308 M 205
P 309 A 206
V 310 K 207
P 311 I 208
M 312 A 209
V 313 R 210
E 314 D 211
A 315 L 212
V 316 F 213
R 317 C 214
S 318 S 215
W 319 R 217
L 320 N 218
D 321 A 219
T 322 R 220
Q 323 E 221
G 324 D 222
I 325 R 223
Q 326 L 224
P 327 F 225
A 328 G 226
N 329 D 227
F 330 A 228
L 331 F 229
TER
END

