
PFRMAT AL
TARGET T0119
AUTHOR 3092-8926-3558
METHOD PDB BLAST http://bioinformatics.ljcrf.edu/pdb_blast/
METHOD 1) Use PSI-Blast to collect homologs and create a sequence profile
METHOD    for the family.
METHOD 2) Use created profile to search for related proteins in PDB
MODEL  1
PARENT 1CNF
REMARK DATE	1995-04-27
REMARK SCORE	 3e-50	192	48/254 (18%)
H 107 G 11
H 108 R 12
F 109 I 13
E 110 H 14
G 111 C 15
T 112 R 16
L 113 L 17
A 114 V 18
R 115 A 19
V 116 K 20
E 117 K 21
N 118 E 22
L 119 L 23
S 120 S 24
D 121 R 25
S 122 D 26
T 123 V 27
I 124 R 28
T 125 L 29
F 126 F 30
D 127 R 31
I 128 F 32
Q 129 S 33
L 130 L 34
D 131 P 35
D 132 S 36
G 133 P 37
Q 134 D 38
P 135 Q 39
D 136 V 40
I 137 L 41
H 138 G 42
F 139 L 43
L 140 P 44
A 141 I 45
G 142 G 46
Q 143 K 47
Y 144 H 48
V 145 I 49
N 146 F 50
V 147 V 51
T 148 T 54
L 149 I 55
P 150 E 56
G 151 G 57
T 152 K 58
T 153 L 59
E 154 C 60
T 155 M 61
R 156 R 62
S 157 A 63
Y 158 Y 64
S 159 T 65
F 160 P 66
S 161 T 67
S 162 S 68
Q 163 M 69
P 164 V 70
G 165 D 71
N 166 E 72
R 167 G 74
L 168 H 75
T 169 F 76
G 170 D 77
F 171 L 78
V 172 L 79
V 173 V 80
R 174 K 81
N 175 V 82
V 176 Y 83
P 177 N 93
Q 178 G 94
G 179 G 95
K 180 L 96
M 181 M 97
S 182 T 98
E 183 Q 99
Y 184 Y 100
L 185 L 101
V 187 D 102
Q 188 S 103
A 189 L 104
K 190 P 105
A 191 V 106
G 192 G 107
D 193 S 108
K 194 Y 109
M 195 I 110
S 196 D 111
F 197 V 112
T 198 K 113
G 199 G 114
P 200 P 115
F 201 L 116
G 202 G 117
S 203 H 118
F 204 V 119
Y 205 E 120
L 206 Y 121
R 207 Q 133
D 208 R 134
V 209 N 135
K 210 A 136
R 211 R 137
P 212 R 138
V 213 L 139
L 214 A 140
M 215 M 141
L 216 I 142
A 217 C 143
G 218 G 144
G 219 G 145
T 220 S 146
G 221 G 147
I 222 I 148
A 223 T 149
P 224 P 150
F 225 M 151
L 226 Y 152
S 227 Q 153
M 228 I 154
L 229 I 155
Q 230 Q 156
V 231 A 157
L 232 V 158
E 233 L 159
Q 234 Q 162
K 235 P 163
G 236 E 164
S 237 D 165
E 238 H 166
H 239 T 167
P 240 E 168
V 241 M 169
R 242 H 170
L 243 L 171
V 244 V 172
F 245 Y 173
G 246 A 174
V 247 N 175
T 248 R 176
Q 249 T 177
D 250 E 178
C 251 D 179
D 252 D 180
L 253 I 181
V 254 L 182
A 255 L 183
L 256 R 184
E 257 D 185
Q 258 E 186
L 259 L 187
D 260 D 188
A 261 R 189
L 262 W 190
Q 263 A 191
Q 264 A 192
K 265 E 193
L 266 Y 194
P 267 P 195
W 268 R 197
F 269 L 198
E 270 K 199
Y 271 V 200
R 272 W 201
T 273 Y 202
V 274 V 203
V 275 I 204
A 276 D 205
H 277 Q 206
A 278 E 211
E 279 E 212
S 280 G 213
Q 281 W 214
H 282 K 215
E 283 Y 216
R 284 S 217
K 285 V 218
G 286 G 219
Y 287 F 220
V 288 V 221
T 289 T 222
G 290 E 223
H 291 A 224
I 292 V 225
E 293 L 226
Y 294 R 227
D 295 E 228
W 296 H 229
L 297 V 230
N 298 P 231
G 299 E 232
G 300 D 235
E 301 D 236
V 302 T 237
D 303 L 238
V 304 A 239
Y 305 L 240
L 306 A 241
C 307 C 242
G 308 G 243
P 309 P 244
V 310 P 245
P 311 P 246
M 312 M 247
V 313 I 248
E 314 Q 249
A 315 A 251
V 316 I 252
R 317 S 253
S 318 P 254
W 319 N 255
L 320 L 256
D 321 E 257
T 322 K 258
Q 323 M 259
G 324 K 260
I 325 Y 261
Q 326 D 262
TER
END

