
PFRMAT AL
TARGET T0116
AUTHOR 8971-8833-9593
METHOD FFAS (http://bioinformatics.burnham-inst.org/FFAS/)
METHOD Fold & Function Assignment System A profile-profile alignment method.
METHOD 1) PSI-Blast is used to collect homologs
METHOD 2) The sequences of homologs are translated into a profile
METHOD    [The translation is not based on PSI-Blast approach]
METHOD 3) Translated profile is aligned against a profile database
MODEL  4
PARENT 1CII
REMARK DATE	1998-01-14
REMARK SCORE	?
K 156 W 60
G 157 V 61
T 158 D 62
V 159 D 63
L 160 S 64
K 161 P 65
S 162 T 66
K 163 R 67
S 164 S 68
A 165 D 69
L 166 I 70
Y 167 E 71
D 168 K 72
E 169 R 73
L 170 D 74
F 171 K 75
R 172 E 76
H 173 I 77
R 174 T 78
P 175 A 79
A 176 Y 80
E 177 K 81
V 178 N 82
L 179 T 83
L 180 L 84
A 181 S 85
P 182 A 86
E 183 Q 87
L 184 Q 88
L 185 K 89
E 186 E 90
N 187 N 91
G 188 E 92
A 189 N 93
F 190 K 94
L 191 R 95
D 192 T 96
E 193 E 97
F 194 A 98
R 195 G 99
K 196 K 100
R 197 R 101
F 198 L 102
P 199 S 103
V 200 A 104
M 201 A 105
L 202 I 106
S 203 A 107
E 204 E 110
A 205 K 111
P 206 D 112
F 207 E 113
E 208 N 114
P 209 T 115
E 210 L 116
G 211 K 117
E 212 T 118
G 213 L 119
P 214 R 120
L 215 A 121
A 216 G 122
L 217 N 123
R 218 A 124
R 219 D 125
A 220 A 126
R 221 A 127
G 222 D 128
A 223 I 129
L 224 T 130
L 225 R 131
A 226 Q 132
Y 227 E 133
A 228 F 134
Q 229 R 135
R 230 L 136
T 231 L 137
Q 232 Q 138
G 233 A 139
G 234 E 140
A 235 L 141
L 236 R 142
S 237 E 143
L 238 Y 144
Q 239 G 145
P 240 F 146
F 241 R 147
R 242 T 148
F 243 E 149
Y 244 I 150
D 245 A 151
P 246 G 152
G 247 Y 153
A 248 D 154
F 249 A 155
M 250 L 156
R 251 R 157
L 252 L 158
P 253 H 159
E 254 T 160
A 255 E 161
T 256 S 162
L 257 R 163
R 258 M 164
A 259 L 165
L 260 F 166
E 261 A 167
V 262 D 168
F 263 A 169
E 264 D 170
P 265 S 171
L 266 L 172
R 267 R 173
G 268 I 174
Q 269 S 175
D 270 P 176
T 271 A 179
L 272 R 180
F 273 S 181
S 274 L 182
V 275 I 183
L 276 E 184
D 277 Q 185
E 278 A 186
T 279 E 187
R 280 K 188
T 281 R 189
A 282 Q 190
P 283 K 191
G 284 D 192
R 285 A 193
R 286 Q 194
L 287 N 195
L 288 A 196
Q 289 D 197
S 290 K 198
W 291 K 199
L 292 A 200
R 293 A 201
H 294 D 202
P 295 M 203
L 296 L 204
L 297 A 205
D 298 E 206
R 299 Y 207
G 300 E 208
P 301 R 209
L 302 K 211
E 303 G 212
A 304 I 213
R 305 L 214
L 306 D 215
D 307 T 216
R 308 R 217
V 309 L 218
E 310 S 219
G 311 E 220
F 312 L 221
V 313 K 223
R 314 N 224
E 315 G 225
G 316 G 226
A 317 A 227
L 318 A 228
R 319 L 229
E 320 A 230
G 321 V 231
V 322 L 232
R 323 D 233
R 324 A 234
L 325 Q 235
L 326 Q 236
Y 327 A 237
R 328 R 238
L 329 L 239
A 330 L 240
D 331 G 241
L 332 Q 242
E 333 Q 243
R 334 T 244
L 335 R 245
A 336 N 246
T 337 D 247
R 338 R 248
L 339 A 249
E 340 I 250
L 341 S 251
G 342 E 252
R 343 A 253
A 344 R 254
S 345 N 255
P 346 K 256
K 347 L 257
D 348 S 258
L 349 S 259
G 350 V 260
A 351 T 261
L 352 S 263
R 353 L 264
R 354 N 265
S 355 T 266
L 356 A 267
Q 357 R 268
I 358 N 269
L 359 A 270
P 360 L 271
E 361 T 272
L 362 R 273
R 363 A 274
A 364 E 275
L 365 Q 276
L 366 Q 277
G 367 L 278
E 368 T 279
E 369 Q 280
V 370 Q 281
G 371 K 282
L 372 N 283
P 373 T 284
D 374 P 285
L 375 D 286
S 376 G 287
P 377 K 288
L 378 T 289
K 379 I 290
E 380 V 291
E 381 S 292
L 382 P 293
E 383 E 294
A 384 K 295
A 385 F 296
L 386 P 297
V 387 G 298
E 388 R 299
D 389 S 300
P 390 S 301
P 391 T 302
L 392 N 303
K 393 D 304
V 394 S 305
S 395 I 306
E 396 V 307
G 397 V 308
G 398 S 309
L 399 G 310
I 400 D 311
R 401 P 312
E 402 R 313
G 403 F 314
Y 404 A 315
D 405 G 316
P 406 T 317
D 407 I 318
L 408 K 319
D 409 I 320
A 410 T 321
L 411 T 322
R 412 S 323
A 413 A 324
A 414 V 325
H 415 I 326
R 416 D 327
E 417 N 328
G 418 R 329
V 419 A 330
A 420 N 331
Y 421 L 332
F 422 N 333
L 423 Y 334
E 424 L 335
L 425 L 336
E 426 S 337
E 427 H 338
R 428 S 339
E 429 G 340
R 430 L 341
E 431 D 342
R 432 Y 343
T 433 K 344
G 434 R 345
I 435 N 346
P 436 I 347
T 437 L 348
L 438 N 349
K 439 D 350
V 440 R 351
G 441 N 352
Y 442 P 353
N 443 V 354
A 444 V 355
V 445 T 356
F 446 E 357
G 447 D 358
Y 448 V 359
Y 449 E 360
L 450 G 361
E 451 D 362
V 452 K 363
T 453 K 364
R 454 I 365
P 455 Y 366
Y 456 N 367
Y 457 A 368
E 458 E 369
R 459 V 370
V 460 A 371
P 461 E 372
K 462 W 373
E 463 D 374
Y 464 K 375
R 465 L 376
P 466 R 377
V 467 Q 378
Q 468 R 379
T 469 L 380
L 470 L 381
K 471 D 382
D 472 A 383
R 473 R 384
Q 474 N 385
R 475 K 386
Y 476 I 387
T 477 T 388
L 478 S 389
P 479 A 390
E 480 E 391
M 481 S 392
K 482 A 393
E 483 V 394
K 484 N 395
E 485 S 396
R 486 A 397
E 487 R 398
V 488 N 399
Y 489 N 400
R 490 L 401
L 491 S 402
E 492 A 403
A 493 R 404
L 494 T 405
I 495 N 406
R 496 E 407
R 497 Q 408
R 498 K 409
E 499 H 410
E 500 A 411
E 501 N 412
V 502 D 413
F 503 A 414
L 504 L 415
E 505 N 416
V 506 A 417
R 507 L 418
TER
END

