
PFRMAT AL
TARGET T0116
AUTHOR 5619-7722-4694
REMARK Predictor remarks
METHOD Automated CAFASP2 submission
METHOD see http://cafasp.bioinfo.pl/server/3dpssm.html
METHOD and Kelley LA, MacCallum RM & Sternberg MJE (2000).
METHOD     Enhanced Genome Annotation using Structural Profiles
METHOD     in the Program 3D-PSSM. J. Mol. Biol. 299(2), 501-522.
METHOD
METHOD Major differences from the publication:
METHOD
METHOD Fold library based on SCOP 1.50 - no more than 70% pairwise
METHOD identity (astral-scopdom-seqres-sel-gs-bib-70-1.50).
METHOD
METHOD Fold library continuously updated from PDB, using 70%
METHOD identity cut-off and overlap criteria.
METHOD
METHOD The 3D-PSSM E-value is multiplied by the SAWTED E-value
METHOD if the latter is less than 0.2 and folds with SAWTED E-values
METHOD less than 0.2 do not belong to different superfamilies.
METHOD
MODEL 1
PARENT 1t7p_A
R  174 M 1
P  175 I 2
A  176 V 3
E  177 S 4
V  178 D 5
L  179 I 6
L  180 E 7
A  181 A 8
P  182 N 9
E  183 A 10
L  184 L 11
L  185 L 12
E  186 E 13
N  187 S 14
L  191 V 15
D  192 T 16
E  193 K 17
F  194 F 18
R  195 H 19
F  198 C 20
P  199 G 21
V  200 V 22
M  201 I 23
L  202 Y 24
S  203 D 25
E  204 Y 26
A  205 S 27
P  206 T 28
F  207 A 29
E  208 E 30
P  209 Y 31
E  210 V 32
G  211 S 33
E  212 Y 34
G  213 R 35
P  214 P 36
L  215 S 37
A  216 D 38
L  217 F 39
R  218 G 40
R  219 A 41
A  220 Y 42
R  221 L 43
G  222 D 44
A  223 A 45
L  224 L 46
L  225 E 47
A  226 A 48
Y  227 E 49
A  228 V 50
Q  229 A 51
R  230 R 52
G  233 G 53
G  234 G 54
A  235 L 55
L  236 I 56
S  237 V 57
L  238 F 58
Q  239 H 59
P  240 N 60
F  241 G 61
R  242 H 62
F  243 K 63
Y  244 Y 64
D  245 D 65
P  246 V 66
G  247 P 67
A  248 A 68
F  249 L 69
M  250 T 70
R  251 K 71
L  252 L 72
A  255 A 73
T  256 K 74
L  257 L 75
R  258 Q 76
A  259 L 77
L  260 N 78
E  261 R 79
V  262 E 80
F  263 F 81
E  264 H 82
R  267 L 83
G  268 P 84
Q  269 R 85
D  270 E 86
T  271 N 87
L  272 C 88
F  273 I 89
S  274 D 90
V  275 T 91
L  276 L 92
P  283 V 93
G  284 L 94
R  285 S 95
R  286 R 96
L  287 L 97
L  288 I 98
Q  289 H 99
S  290 S 100
W  291 N 101
L  292 L 102
R  293 K 103
H  294 D 104
P  295 G 108
L  296 L 109
L  297 L 110
D  298 R 111
R  299 S 112
G  300 G 113
P  301 K 114
L  302 L 115
E  303 P 116
A  304 G 117
R  305 A 124
L  306 L 125
D  307 E 126
R  308 A 127
V  309 W 128
E  310 G 129
G  311 Y 130
F  312 R 131
V  313 L 132
R  314 G 133
E  315 E 134
G  316 G 137
A  317 E 138
L  318 Y 139
R  319 K 140
E  320 D 141
G  321 D 142
V  322 F 143
R  323 K 144
R  324 R 145
L  325 M 146
L  326 L 147
L  329 E 148
A  330 E 149
D  331 Q 150
L  332 G 151
E  333 E 152
R  334 E 153
L  335 Y 154
A  336 V 155
T  337 D 156
R  338 G 157
L  339 M 158
E  340 E 159
L  341 W 160
G  342 W 161
R  343 N 162
A  344 F 163
S  345 N 164
P  346 E 165
K  347 E 166
D  348 M 167
L  349 M 168
G  350 D 169
A  351 Y 170
L  352 N 171
R  353 V 172
R  354 Q 173
S  355 D 174
L  356 V 175
Q  357 V 176
I  358 V 177
L  359 T 178
P  360 K 179
E  361 A 180
L  362 L 181
R  363 E 183
A  364 K 184
L  365 L 185
L  366 L 186
G  367 S 187
E  368 D 188
E  369 K 189
V  370 I 196
G  371 D 197
L  372 F 198
P  373 T 199
D  374 D 200
L  375 T 204
S  376 T 205
P  377 F 206
L  378 W 207
K  379 S 208
E  380 E 209
E  381 S 210
L  382 L 211
E  383 E 212
A  384 A 213
A  385 V 214
L  386 D 215
V  387 I 216
E  388 E 217
D  389 H 218
P  390 R 219
P  391 A 220
L  392 A 221
K  393 W 222
V  394 L 223
S  395 L 224
G  397 A 225
G  398 K 226
L  399 Q 227
I  400 E 228
R  401 R 229
E  402 N 230
G  403 G 231
Y  404 F 232
D  405 P 233
P  406 F 234
D  407 D 235
L  408 T 236
D  409 K 237
A  410 A 238
L  411 I 239
R  412 E 240
A  413 E 241
A  414 L 242
H  415 Y 243
R  416 V 244
E  417 E 245
G  418 L 246
V  419 A 247
A  420 A 248
Y  421 R 249
F  422 R 250
L  423 S 251
E  424 E 252
L  425 L 253
E  426 L 254
E  427 R 255
R  428 K 256
E  429 L 257
R  430 T 258
E  431 E 259
R  432 T 260
T  433 F 261
G  434 G 262
F  446 S 263
G  447 W 264
Y  448 Y 265
Y  449 Q 266
L  450 P 267
E  451 K 268
V  452 G 269
T  453 G 270
R  454 T 271
P  455 E 272
Y  456 C 275
Y  457 H 276
E  458 P 277
R  459 R 278
V  460 L 283
P  461 P 284
K  462 K 285
E  463 Y 286
Y  464 P 287
R  465 R 288
P  466 P 292
V  467 K 293
Q  468 E 319
T  469 Y 320
L  470 V 321
K  471 A 322
D  472 G 323
R  473 A 324
Q  474 P 325
R  475 V 333
Y  476 F 334
T  477 N 335
L  478 P 336
P  479 S 337
E  480 S 338
M  481 R 339
K  482 D 340
E  483 H 341
K  484 I 342
E  485 Q 343
R  486 K 344
E  487 K 345
V  488 L 346
Y  489 Q 347
R  490 E 348
L  491 A 349
E  492 G 350
A  493 W 351
L  494 V 352
I  495 P 353
R  496 P 362
R  497 V 363
R  498 V 364
E  499 D 365
E  500 D 366
E  501 E 367
V  502 V 368
F  503 L 369
L  504 E 370
E  505 G 371
V  506 V 372
R  507 R 373
E  508 P 377
R  509 E 378
A  510 K 379
K  511 Q 380
R  512 A 381
Q  513 A 382
A  514 I 383
E  515 D 384
A  516 L 385
L  517 I 386
R  518 K 387
E  519 E 388
A  520 Y 389
A  521 L 390
R  522 M 391
I  523 I 392
L  524 Q 393
A  525 K 394
E  526 R 395
L  527 I 396
D  528 G 397
V  529 Q 398
Y  530 S 399
A  531 A 400
A  532 A 405
L  533 W 406
A  534 L 407
E  535 R 408
V  536 Y 409
A  537 V 410
V  538 A 411
R  539 E 412
Y  540 D 413
G  541 G 414
Y  542 K 415
V  543 I 416
R  544 H 417
P  545 G 418
R  546 S 419
F  547 V 420
I  553 N 421
R  554 P 422
A  555 N 423
G  556 G 424
R  557 A 425
V  560 V 426
V  561 T 427
E  562 G 428
R  563 R 429
R  564 A 430
T  565 T 431
E  566 H 432
F  567 A 433
V  568 F 434
P  569 P 435
N  570 N 436
L  572 L 437
E  573 A 438
M  574 Q 439
A  575 I 440
H  576 P 441
E  577 G 442
G  583 V 443
P  584 R 444
N  585 S 445
M  586 P 446
A  587 Y 447
G  588 G 448
K  589 E 449
S  590 Q 450
L  593 C 451
R  594 R 452
Q  595 A 453
A  600 A 454
L  601 F 455
L  602 G 456
A  603 A 457
Q  604 E 458
V  605 H 459
G  606 H 460
S  607 D 462
F  608 G 463
V  609 I 464
P  610 T 465
A  611 G 466
E  612 K 467
E  613 P 468
A  614 W 469
H  615 V 470
L  616 Q 471
P  617 A 472
L  618 G 473
F  619 I 474
D  620 D 475
G  621 G 478
I  622 L 479
Y  623 E 480
T  624 L 481
R  625 R 482
I  626 C 483
G  627 D 492
A  628 N 493
S  629 G 494
D  630 E 495
D  631 Y 496
L  632 A 497
A  633 I 500
G  634 L 501
G  635 N 502
K  636 G 503
S  637 D 504
T  638 I 505
F  639 H 506
M  640 T 507
V  641 K 508
E  642 N 509
M  643 Q 510
E  644 I 511
E  645 A 512
V  646 A 513
A  647 Y 526
L  648 G 527
I  649 F 528
L  650 L 529
K  651 Y 530
E  652 G 531
A  653 A 532
T  654 G 533
E  655 D 534
N  656 E 535
S  657 K 536
L  658 I 537
L  671 G 538
D  672 Q 539
G  673 I 540
V  674 V 541
A  675 G 542
I  676 A 543
A  677 G 544
T  678 K 545
A  679 E 546
V  680 R 547
A  681 G 548
E  682 K 549
A  683 E 550
L  684 L 551
H  685 K 552
E  686 K 553
R  687 K 554
R  688 E 557
A  689 N 558
Y  690 T 559
T  691 P 560
L  692 A 561
F  693 I 562
A  694 A 563
T  695 A 564
H  696 L 565
Y  697 R 566
F  698 E 567
E  699 S 568
L  700 I 569
T  701 Q 570
A  702 Q 571
L  703 T 572
G  704 L 573
L  705 V 574
P  706 E 575
R  707 K 587
L  708 W 588
K  709 K 589
N  710 R 590
L  711 R 591
H  712 W 592
V  713 I 593
E  717 K 594
E  718 G 595
A  719 L 596
G  720 D 597
G  721 G 598
L  722 R 599
V  723 K 600
F  724 V 601
Y  725 H 602
L  729 V 603
P  730 R 604
G  731 S 605
P  732 P 606
A  733 H 607
S  734 A 608
K  735 A 609
S  736 N 611
Y  737 T 612
G  738 L 613
V  739 L 614
E  740 Q 615
V  741 S 616
A  742 A 617
A  743 G 618
A  745 A 619
G  746 L 620
L  747 I 621
P  748 C 622
K  749 K 623
E  750 L 624
V  751 W 625
V  752 I 626
A  753 I 627
R  754 K 628
A  755 T 629
R  756 E 630
A  757 E 631
L  758 M 632
L  759 L 633
Q  760 V 634
A  761 E 635
M  762 K 636
A  763 G 637
A  764 L 638
R  765 K 639
R  766 H 640
E  767 G 641
G  768 W 642
A  769 D 643
L  770 G 644
D  771 D 645
A  772 F 646
V  773 V 652
L  774 H 653
E  775 D 654
R  776 E 655
L  777 I 656
L  778 Q 657
A  779 V 658
L  780 G 659
D  781 C 660
P  782 R 661
D  783 T 662
R  784 E 663
L  785 E 664
T  786 I 665
P  787 A 666
L  788 Q 667
E  789 V 668
A  790 V 669
L  791 I 670
R  792 E 671
L  793 T 672
L  794 A 673
Q  795 Q 674
E  796 E 675
L  797 A 676
K  798 I 702
A  799 C 703
L  800 H 704
TER
END

