
PFRMAT AL
TARGET T0116
AUTHOR 3359-3308-3659
REMARK FUGUE AUTOMATIC ALIGNMENT
REMARK ZSCORE=3.39 
REMARK CONFIDENCE: UNCERTAIN (less than 50% confidence [ ZSCORE<3.5 ])
REMARK DERIVED FROM HOMSTRAD PROFILE: hsd1adea
METHOD Environment-specific substitution tables were derived from the structure-based
METHOD alignments in the HOMSTRAD database. Each alignment in HOMSTRAD was converted
METHOD into a scoring template (profile) using the environment-specific substitution 
METHOD tables and structure-dependent gap penalties. The program FUGUE searches
METHOD a sequence or sequence alignment against the library of profiles.
MODEL  4
PARENT 1ade_A
M   1     L     7
E   2     G     8
G   3     T     9
M   4     Q    10
L   5     W    11
K   6     G    12
G   7     D    13
E   8     E    14
G   9     G    15
P  10     K    16
G  11     G    17
P  12     K    18
L  13     I    19
P  14     V    20
P  15     D    21
L  16     L    22
L  17     L    23
Q  18     T    24
Q  26     E    25
Y  27     R    26
P  28     A    27
D  29     K    28
Y  30     Y    29
L  31     V    30
L  32     V    31
L  33     R    32
F  34     Y    33
Q  35     Q    34
V  36     G    35
G  37     G    36
D  38     H    37
F  39     N    38
Y  40     A    39
E  41     G    40
T  59     H    41
H  60     T    42
K  61     L    43
T  62     V    44
S  63     I    45
K  64     N    46
D  65     G    47
F  66     E    48
T  67     K    49
T  68     T    50
P  69     V    51
M  70     L    52
A  71     H    53
G  72     L    54
I  73     I    55
P  74     P    56
E 105     S    57
G 106     G    58
L 107     I    59
V 108     L    60
R 109     R    61
R 110     E    62
E 111     N    63
V 112     V    64
T 113     T    65
Q 114     S    66
L 115     I    67
L 116     I    68
T 117     G    69
P 118     N    70
G 119     G    71
T 120     V    72
L 121     V    73
L 122     L    74
Q 123     S    75
E 124     P    76
S 125     A    77
L 126     A    78
L 127     L    79
P 128     M    80
R 129     K    81
E 130     E    82
A 131     M    83
N 132     K    84
Y 133     E    85
L 134     L    86
A 135     E    87
A 136     D    88
I 137     R    89
R 293     G    90
H 294     I    91
P 295     P    92
L 296     V    93
L 297     R    94
D 298     E    95
R 299     R    96
G 300     L    97
P 301     L    98
L 302     L    99
E 303     S   100
A 304     E   101
R 305     A   102
L 306     C   103
D 307     P   104
R 308     L   105
V 309     I   106
E 310     L   107
G 311     D   108
F 312     Y   109
V 313     H   110
R 314     V   111
E 315     A   112
G 316     L   113
A 317     D   114
L 318     N   115
R 319     A   116
E 320     R   117
G 321     E   118
V 322     K   119
R 323     A   120
R 324     R   121
L 325     G   122
L 326     A   123
Y 327     K   124
R 328     A   125
L 329     I   126
A 330     G   127
D 331     T   128
L 332     T   129
E 333     G   130
R 334     R   131
L 335     G   132
A 336     I   133
T 337     G   134
R 338     P   135
L 339     A   136
E 340     Y   137
L 341     E   138
G 342     D   139
R 343     K   140
A 344     V   141
S 345     A   142
P 346     R   143
K 347     R   144
D 348     G   145
L 349     L   146
E 361     R   147
L 362     V   148
R 363     G   149
A 364     D   150
L 365     L   151
L 366     F   152
G 367     D   153
E 368     K   154
E 369     E   155
V 370     T   156
G 371     F   157
L 372     A   158
P 373     E   159
D 374     K   160
L 375     L   161
S 376     K   162
P 377     E   163
L 378     V   164
K 379     M   165
E 380     E   166
E 381     Y   167
L 382     H   168
E 383     N   169
A 384     F   170
A 385     Q   171
L 386     L   172
V 387     V   173
E 388     N   174
D 389     Y   175
P 390     Y   176
P 391     K   177
L 392     A   178
K 393     E   179
V 394     A   180
S 395     V   181
E 396     D   182
G 397     Y   183
G 398     Q   184
L 399     K   185
I 400     V   186
R 401     L   187
E 402     D   188
G 403     D   189
Y 404     T   190
D 405     M   191
P 406     A   192
D 407     V   193
L 408     A   194
D 409     D   195
A 410     I   196
L 411     L   197
R 412     T   198
A 413     S   199
A 414     M   200
H 415     V   201
R 416     V   202
E 417     D   203
G 418     V   204
V 419     S   205
A 420     D   206
Y 421     L   207
F 422     L   208
L 423     D   209
E 424     Q   210
L 425     A   211
E 426     R   212
E 427     Q   213
R 428     R   214
E 429     G   215
R 430     D   216
K 439     F   217
V 440     V   218
G 441     M   219
Y 442     F   220
N 443     E   221
A 444     G   222
V 445     A   223
F 446     Q   224
G 447     G   225
Y 448     T   226
Y 449     L   227
L 450     L   228
E 451     D   229
V 452     I   230
T 453     D   231
R 454     H   232
P 455     G   233
Y 456     T   234
Y 457     Y   235
E 458     P   236
R 459     Y   237
V 460     V   238
P 461     T   239
K 462     S   240
E 463     S   241
Y 464     N   242
R 465     T   243
P 466     T   244
V 467     A   245
Q 468     G   246
T 469     G   247
L 470     V   248
K 471     A   249
D 472     T   250
R 473     G   251
Q 474     S   252
R 475     G   253
Y 476     L   254
T 477     G   255
L 524     P   256
A 525     R   257
E 526     Y   258
L 527     V   259
D 528     D   260
V 529     Y   261
Y 530     V   262
A 531     L   263
A 532     G   264
L 533     I   265
A 534     L   266
E 535     K   267
V 536     A   268
A 537     Y   269
V 538     S   270
R 539     T   271
Y 540     R   272
G 541     V   273
Y 542     G   274
V 543     A   275
R 544     G   276
P 545     P   277
F 567     F   278
V 568     P   279
P 569     T   280
N 570     E   281
D 571     L   282
L 572     F   283
E 573     D   284
M 574     E   285
A 575     T   286
H 576     G   287
E 577     E   288
L 578     F   289
V 579     L   290
L 580     C   291
I 581     K   292
T 582     Q   293
G 583     G   294
P 584     N   295
N 585     E   296
M 586     F   297
A 587     G   298
G 588     A   299
K 589     T   300
S 590     T   301
T 591     G   302
F 592     R   303
L 593     R   304
R 594     R   305
R 625     R   306
I 626     T   307
G 627     G   308
A 628     W   309
S 629     L   310
D 630     D   311
A 647     T   312
L 648     V   313
I 649     A   314
L 650     V   315
K 651     R   316
E 652     R   317
A 653     A   318
T 654     V   319
E 655     Q   320
N 656     L   321
S 657     N   322
S 670     S   323
L 671     L   324
D 672     S   325
G 673     G   326
V 674     F   327
A 675     C   328
I 676     L   329
A 677     T   330
T 678     K   331
A 681     L   332
E 682     D   333
A 683     V   334
L 684     L   335
H 685     D   336
E 686     G   337
R 687     L   338
R 688     K   339
A 689     E   340
Y 690     V   341
T 691     K   342
L 692     L   343
F 693     C   344
A 694     V   345
T 695     A   346
H 696     Y   347
Y 697     R   348
L 703     M   349
G 704     P   350
L 705     D   351
P 706     G   352
R 707     R   353
L 708     E   354
K 709     V   355
N 710     T   356
L 711     T   357
H 712     T   358
V 713     P   359
A 714     L   360
A 715     A   361
R 716     A   362
E 717     D   363
E 718     D   364
A 719     W   365
G 720     K   366
G 721     G   367
L 722     V   368
V 723     E   369
F 724     P   370
Y 725     I   371
H 726     Y   372
Q 727     E   373
V 728     T   374
L 729     M   375
P 730     P   376
G 731     G   377
P 732     W   378
A 733     S   379
S 734     E   380
K 735     S   381
S 736     T   382
Y 737     F   383
G 738     G   384
V 741     V   385
A 742     K   386
A 743     D   387
M 744     R   388
A 745     S   389
G 746     G   390
L 747     L   391
P 748     P   392
A 753     Q   393
R 754     A   394
A 755     A   395
R 756     L   396
A 757     N   397
L 758     Y   398
L 759     I   399
Q 760     K   400
A 761     R   401
M 762     I   402
A 763     E   403
A 764     E   404
R 765     L   405
R 766     T   406
E 767     G   407
G 768     V   408
A 769     P   409
L 770     I   410
D 771     D   411
A 772     I   412
V 773     I   413
L 774     S   414
L 780     T   415
D 781     G   416
P 782     P   417
D 783     D   418
R 784     R   419
L 785     T   420
T 786     E   421
P 787     T   422
L 788     M   423
E 789     I   424
A 790     L   425
L 791     R   426
R 792     D   427
L 793     P   428
L 794     F   429
Q 795     D   430
E 796     A   431
TER
END

