
PFRMAT AL
TARGET T0115
AUTHOR 8971-8833-9593
METHOD FFAS (http://bioinformatics.burnham-inst.org/FFAS/)
METHOD Fold & Function Assignment System A profile-profile alignment method.
METHOD 1) PSI-Blast is used to collect homologs
METHOD 2) The sequences of homologs are translated into a profile
METHOD    [The translation is not based on PSI-Blast approach]
METHOD 3) Translated profile is aligned against a profile database
MODEL  3
PARENT 1BU7_B
REMARK DATE	2000-05-03
REMARK SCORE	?
D 23 N 16
V 24 L 17
F 25 P 18
G 26 L 19
L 27 L 20
C 28 N 21
L 29 T 22
K 30 D 23
E 31 K 24
P 32 P 25
Y 33 V 26
D 34 Q 27
V 35 A 28
I 36 L 29
E 37 M 30
V 38 K 31
E 39 I 32
A 40 A 33
I 41 D 34
D 42 E 35
D 43 E 38
K 44 I 39
E 45 F 40
I 46 K 41
I 47 F 42
I 48 E 43
E 49 A 44
V 50 P 45
D 51 G 46
D 52 R 47
K 53 V 48
N 54 T 49
I 55 R 50
P 56 Y 51
T 57 L 52
D 58 S 53
P 59 S 54
D 60 Q 55
K 61 R 56
N 62 L 57
V 63 I 58
A 64 K 59
G 65 E 60
I 66 A 61
V 67 C 62
A 68 D 63
K 69 E 64
K 70 S 65
M 71 R 66
I 72 F 67
D 73 D 68
D 74 K 69
F 75 N 70
N 76 L 71
I 77 S 72
G 78 Q 73
K 79 A 74
G 80 L 75
V 81 K 76
K 82 F 77
I 83 V 78
T 84 R 79
I 85 D 80
K 86 F 81
K 87 A 82
G 88 G 83
V 89 D 84
K 90 G 85
A 91 L 86
G 92 F 87
S 93 T 88
G 94 S 89
L 95 W 90
G 96 T 91
S 97 H 92
S 98 I 102
A 99 L 103
A 100 L 104
S 101 P 105
S 102 S 106
A 103 F 107
G 104 S 108
T 105 Q 109
A 106 Q 110
Y 107 A 111
A 108 M 112
I 109 K 113
N 110 G 114
E 111 H 116
L 112 A 117
F 113 M 118
K 114 M 119
L 115 V 120
N 116 D 121
L 117 I 122
D 118 A 123
K 119 V 124
L 120 Q 125
K 121 L 126
L 122 V 127
V 123 Q 128
D 124 K 129
Y 125 W 130
A 126 E 131
S 127 R 132
Y 128 L 133
G 129 N 134
E 130 A 135
L 131 D 136
A 132 E 137
S 133 H 138
S 134 I 139
G 135 E 140
A 136 V 141
K 137 P 142
H 138 E 143
A 139 D 144
D 140 M 145
N 141 T 146
V 142 R 147
A 143 L 148
P 144 T 149
A 145 L 150
I 146 D 151
F 147 T 152
G 148 I 153
G 149 G 154
F 150 L 155
T 151 C 156
M 152 G 157
V 153 F 158
T 154 N 159
N 155 Y 160
Y 156 R 161
E 157 F 162
P 158 N 163
L 159 S 164
E 160 F 165
V 161 Y 166
L 162 R 167
H 163 D 168
I 164 Q 169
P 165 P 170
I 166 H 171
D 167 P 172
F 168 F 173
K 169 I 174
L 170 T 175
D 171 S 176
I 172 M 177
L 173 V 178
I 174 R 179
A 175 L 181
I 176 D 182
P 177 E 183
N 178 A 184
I 179 M 185
S 180 N 186
I 181 K 187
N 182 L 188
T 183 Q 189
K 184 R 190
E 185 A 191
A 186 N 192
R 187 P 193
E 188 D 194
I 189 D 195
L 190 P 196
P 191 A 197
K 192 Y 198
A 193 D 199
V 194 E 200
G 195 N 201
L 196 K 202
K 197 R 203
D 198 Q 204
L 199 F 205
V 200 Q 206
N 201 E 207
N 202 D 208
V 203 I 209
G 204 K 210
K 205 V 211
A 206 M 212
C 207 N 213
G 208 D 214
M 209 L 215
V 210 V 216
Y 211 D 217
A 212 K 218
L 213 I 219
Y 214 I 220
N 215 A 221
K 216 D 222
D 217 R 223
K 218 K 224
S 219 A 225
L 220 S 226
F 221 G 227
G 222 E 228
R 223 Q 229
Y 224 T 235
M 225 H 236
M 226 M 237
S 227 L 238
D 228 N 239
K 229 G 240
V 230 K 241
I 231 D 242
E 232 P 243
P 233 E 244
V 234 T 245
R 235 G 246
G 236 E 247
K 237 P 248
L 238 L 249
I 239 E 252
P 240 N 253
N 241 I 254
Y 242 R 255
F 243 Y 256
K 244 Q 257
I 245 I 258
K 246 I 259
E 247 T 260
E 248 F 261
V 249 L 262
K 250 I 263
D 251 A 264
K 252 G 265
V 253 H 266
Y 254 E 267
G 255 T 268
I 256 T 269
T 257 S 270
I 258 G 271
S 259 L 272
G 260 L 273
S 261 S 274
G 262 F 275
P 263 A 276
S 264 L 277
I 265 Y 278
I 266 F 279
A 267 L 280
F 268 V 281
P 269 K 282
K 270 N 283
E 271 P 284
E 272 H 285
F 273 V 286
I 274 L 287
D 275 Q 288
E 276 K 289
V 277 A 290
E 278 A 291
N 279 E 292
I 280 E 293
L 281 A 294
R 282 A 295
D 283 R 296
Y 284 V 297
Y 285 L 298
E 286 V 299
N 287 D 300
T 288 P 301
I 289 V 302
TER
END

