
PFRMAT AL
TARGET T0115
AUTHOR 3359-3308-3659
REMARK FUGUE AUTOMATIC ALIGNMENT
REMARK ZSCORE=2.88 
REMARK CONFIDENCE: UNCERTAIN (less than 50% confidence [ ZSCORE<3.5 ])
REMARK DERIVED FROM HOMSTRAD PROFILE: hs1dq3a
METHOD Environment-specific substitution tables were derived from the structure-based
METHOD alignments in the HOMSTRAD database. Each alignment in HOMSTRAD was converted
METHOD into a scoring template (profile) using the environment-specific substitution 
METHOD tables and structure-dependent gap penalties. The program FUGUE searches
METHOD a sequence or sequence alignment against the library of profiles.
MODEL  5
PARENT 1dq3_A
M   1     G    77
R   2     K    78
E   3     D    79
I   4     V    80
M   5     T    81
K   6     K    82
V   7     Y    83
R   8     E    84
V   9     I    85
K  10     I    86
A  11     T    87
P  12     N    88
C  13     K    89
T  14     G    90
S  15     T    91
A  16     K    92
N  17     I    93
L  18     L    94
G  19     S    96
V  20     P    97
G  21     W    98
F  22     H    99
D  23     P   100
V  24     F   101
F  25     F   102
G  26     V   103
L  27     L   104
C  28     T   105
L  29     P   106
K  30     D   107
E  31     F   108
P  32     K   109
Y  33     I   110
D  34     V   111
V  35     E   112
I  36     K   113
E  37     R   114
V  38     A   115
E  39     D   116
A  40     E   117
I  41     L   118
D  42     K   119
D  43     E   120
K  44     G   121
E  45     D   122
I  46     I   123
I  47     L   124
I  48     I   125
E  49     M   128
V  50     P   129
D  51     D   130
D  52     G   131
K  53     E   132
N  54     D   133
I  55     Y   134
P  56     K   135
T  57     F   136
D  58     I   137
P  59     F   138
D  60     D   139
K  61     Y   140
N  62     W   141
V  63     L   142
A  64     A   143
G  65     G   144
I  66     F   145
V  67     I   146
A  68     A   147
K  69     G   148
K  70     D   149
M  71     G   150
I  72     C   151
D  73     F   152
D  74     D   153
F  75     K   154
N  76     Y   155
I  77     I   165
G  78     Y   166
K  79     D   167
G  80     R   168
V  81     L   169
K  82     R   170
I  83     I   171
T  84     Y   172
I  85     I   182
K  86     N   183
K  87     D   184
G  88     Y   185
V  89     L   186
K  90     E   187
A  91     K   188
G  92     T   189
S  93     F   190
G  94     G   191
L  95     R   192
G  96     K   193
S  97     Y   194
S  98     S   195
A  99     I   196
A 100     Q   197
S 101     K   198
S 102     D   199
A 103     R   200
G 104     N   201
T 105     I   202
A 106     Y   203
Y 107     Y   204
A 108     I   205
I 109     D   206
N 110     R   210
E 111     N   211
L 112     I   212
F 113     T   213
K 114     S   214
L 115     H   215
N 116     Y   216
L 117     L   217
D 118     K   218
K 119     L   219
L 120     L   220
K 121     E   221
L 122     G   222
V 123     I   223
D 124     D   224
Y 125     N   225
A 126     G   226
S 127     I   227
Y 128     P   228
G 129     P   229
E 130     Q   230
L 131     I   231
A 132     L   232
S 133     K   233
S 134     E   234
G 135     G   235
A 136     K   236
K 137     N   237
H 138     A   238
A 139     V   239
D 140     L   240
N 141     S   241
V 142     F   242
A 143     I   243
P 144     A   244
A 145     G   245
I 146     L   246
F 147     F   247
G 148     D   248
G 149     A   249
F 150     E   250
T 151     G   251
M 152     H   252
V 153     V   253
T 154     S   254
N 155     N   255
Y 156     K   256
E 157     P   257
P 158     G   258
L 159     I   259
E 160     E   260
V 161     L   261
L 162     G   262
H 163     M   263
I 164     V   264
P 165     N   265
I 166     K   266
D 167     R   267
F 168     L   268
K 169     I   269
L 170     E   270
D 171     D   271
I 172     V   272
L 173     T   273
I 174     H   274
A 175     Y   275
I 176     L   276
P 177     N   277
N 178     A   278
I 179     L   279
S 180     G   280
I 181     I   281
N 182     K   282
T 183     A   283
K 184     R   284
E 185     I   285
A 186     R   286
R 187     E   287
E 188     K   288
I 189     L   289
L 190     R   290
P 191     K   291
K 192     D   292
A 193     G   293
V 194     I   294
G 195     D   295
L 196     Y   296
K 197     V   297
D 198     L   298
L 199     H   299
V 200     V   300
N 201     E   301
N 202     E   302
V 203     Y   303
G 204     S   304
K 205     S   305
A 206     L   306
C 207     L   307
G 208     R   308
M 209     F   309
V 210     Y   310
Y 211     E   311
A 212     L   312
L 213     I   313
Y 214     G   314
N 215     K   315
K 216     N   316
D 217     N   319
K 218     E   320
S 219     E   321
L 220     K   322
F 221     R   323
G 222     E   324
R 223     K   325
Y 224     L   326
M 225     E   327
M 226     K   328
S 227     V   329
D 228     L   330
K 229     S   331
V 230     N   332
I 231     H   333
E 232     K   334
P 233     G   335
V 234     G   336
R 235     N   337
G 236     F   338
K 237     G   339
L 238     L   340
I 239     P   341
P 240     L   342
N 241     N   343
Y 242     F   344
F 243     N   345
K 244     A   346
I 245     F   347
K 246     K   348
E 247     E   349
E 248     W   350
V 249     A   351
K 250     S   352
D 251     E   353
Y 254     Y   354
G 255     G   355
I 256     V   356
T 257     E   357
I 258     F   358
S 259     K   359
G 260     T   360
S 261     N   361
G 262     G   362
P 263     S   363
S 264     Q   364
I 265     T   365
I 266     I   366
A 267     A   367
F 268     I   368
P 269     I   369
K 270     N   370
E 271     D   371
E 272     E   372
F 273     R   373
I 274     I   374
D 275     A   388
E 276     V   389
V 277     L   390
E 278     V   391
N 279     K   392
I 280     M   393
L 281     L   394
R 282     R   395
D 283     K   396
Y 284     L   397
Y 285     Y   398
E 286     E   399
N 287     A   400
T 288     T   401
I 289     K   402
R 290     D   403
T 291     E   404
E 292     E   405
V 293     V   406
G 294     K   407
K 295     R   408
G 296     M   409
V 297     L   410
E 298     H   411
V 299     L   412
V 300     I   413
TER
END

