
PFRMAT AL
TARGET T0112
AUTHOR 8734-6605-4366
METHOD Main features of the approach:
METHOD 1. Threading in an external energy field of 'the template results
METHOD    in an alignment of a target sequence on the template.
METHOD    The energy of the obtainedstructure is evaluated using
METHOD    phenomelogical potentials applied to Ca and Cb atoms.
METHOD 2. Averaging over homologs is used in energy calculations.
METHOD 3. "Fragmentation" gapless threading is used for the final
METHOD    selection of predictions
MODEL  2
PARENT 1bto_B
M   1    K    5
A   2    V    6
S   3    I    7
D   4    K    8
N   5    C    9
L   6    K   10
S   7    A   11
A   8    A   12
V   9    V   13
L  10    L   14
Y  11    W   15
K  12    E   16
Q  13    E   17
N  14    K   18
D  15    K   19
L  16    P   20
Q  20    I   23
R  21    E   24
P  22    E   25
I  23    V   26
P  24    E   27
E  25    V   28
P  26    A   29
K  27    P   30
E  28    P   31
D  29    K   32
E  30    A   33
V  31    H   34
L  32    E   35
L  33    V   36
Q  34    R   37
M  35    I   38
A  36    K   39
Y  37    M   40
V  38    V   41
G  39    A   42
I  40    T   43
C  41    G   44
G  42    I   45
S  43    C   46
D  44    R   47
V  45    S   48
H  46    D   49
Y  47    D   50
R  52    V   53
I  53    S   54
A  54    G   55
D  55    T   56
F  56    L   57
I  57    V   58
V  58    T   59
K  59    P   60
D  60    L   61
P  61    P   62
M  62    V   63
V  63    I   64
I  64    A   65
G  65    G   66
H  66    H   67
E  67    E   68
A  68    A   69
S  69    A   70
G  70    G   71
T  71    I   72
V  72    V   73
V  73    E   74
K  74    S   75
V  75    I   76
G  76    G   77
K  77    E   78
N  78    G   79
V  79    V   80
K  80    T   81
H  81    T   82
L  82    V   83
K  83    R   84
K  84    P   85
G  85    G   86
D  86    D   87
R  87    K   88
V  88    V   89
A  89    I   90
V  90    P   91
E  91    L   92
P  92    F   93
G  93    T   94
V  94    P   95
P  95    Q   96
C  96    C   97
R  97    G   98
E 104    D  125
G 105    G  126
K 106    T  127
Y 107    S  128
N 108    R  129
L 109    F  130
C 110    T  131
P 111    C  132
D 112    R  133
L 113    G  134
T 114    K  135
F 115    P  136
C 116    I  137
A 117    H  138
T 118    H  139
P 119    F  140
P 120    L  141
D 121    G  142
D 122    T  143
G 123    S  144
N 124    T  145
L 125    F  146
A 126    S  147
R 127    Q  148
Y 128    Y  149
Y 129    T  150
V 130    V  151
H 131    V  152
A 132    D  153
A 133    E  154
D 134    I  155
F 135    S  156
C 136    V  157
H 137    A  158
K 138    K  159
L 139    I  160
P 140    D  161
D 141    A  162
N 142    A  163
V 143    S  164
S 144    P  165
L 145    L  166
E 146    E  167
E 147    K  168
G 148    V  169
A 149    C  170
L 150    L  171
L 151    I  172
E 152    G  173
P 153    C  174
L 154    G  175
S 155    F  176
V 156    S  177
G 157    T  178
V 158    G  179
H 159    Y  180
A 160    G  181
C 161    S  182
R 162    A  183
R 163    V  184
A 164    K  185
L 168    Q  191
G 169    G  192
T 170    S  193
T 171    T  194
V 172    C  195
L 173    A  196
V 174    V  197
I 175    F  198
G 176    G  199
A 177    L  200
G 178    G  201
P 179    G  202
I 180    V  203
G 181    G  204
L 182    L  205
V 183    S  206
S 184    V  207
V 185    I  208
L 186    M  209
A 187    G  210
A 188    C  211
K 189    K  212
A 190    A  213
Y 191    A  214
G 192    G  215
A 193    A  216
F 194    A  217
V 195    R  218
V 196    I  219
C 197    I  220
T 198    G  221
A 199    V  222
R 200    D  223
S 201    I  224
P 202    N  225
R 203    K  226
R 204    D  227
L 205    K  228
E 206    F  229
V 207    A  230
A 208    K  231
K 209    A  232
N 210    K  233
C 211    E  234
G 212    V  235
A 213    G  236
D 214    A  237
V 215    T  238
T 216    E  239
D 220    N  242
P 221    P  243
A 222    Q  244
K 223    D  245
E 224    Y  246
E 225    K  247
E 226    K  248
I 230    Q  251
E 231    E  252
R 232    V  253
I 233    L  254
R 234    T  255
S 235    E  256
A 236    M  257
I 237    S  258
G 238    N  259
D 239    G  260
L 240    G  261
P 241    V  262
N 242    D  263
V 243    F  264
T 244    S  265
I 245    F  266
D 246    E  267
C 247    V  268
S 248    I  269
G 249    G  270
N 250    R  271
E 251    L  272
K 252    D  273
C 253    T  274
I 254    M  275
T 255    V  276
I 256    T  277
G 257    A  278
I 258    L  279
N 259    S  280
I 260    C  281
T 261    C  282
R 262    Q  283
T 263    E  284
G 264    A  285
G 265    Y  286
T 266    G  287
L 267    V  288
M 268    S  289
L 269    V  290
V 270    I  291
G 271    V  292
M 272    G  293
G 273    V  294
S 274    P  295
Q 275    P  296
M 276    D  297
V 277    S  298
T 278    Q  299
V 279    N  300
P 280    L  301
L 281    S  302
V 282    M  303
N 283    N  304
A 284    P  305
E 288    W  314
I 289    K  315
D 290    G  316
I 291    A  317
K 292    I  318
S 293    F  319
V 294    G  320
F 295    G  321
R 296    F  322
Y 297    K  323
P 302    P  329
I 303    K  330
A 304    L  331
L 305    V  332
E 306    A  333
M 307    D  334
V 308    F  335
A 309    M  336
S 310    A  337
G 311    K  338
R 312    K  339
C 313    F  340
N 314    A  341
V 315    L  342
K 316    D  343
Q 317    P  344
L 318    L  345
V 319    I  346
T 320    T  347
H 321    H  348
S 322    V  349
F 323    L  350
K 324    P  351
L 325    F  352
E 326    E  353
Q 327    K  354
T 328    I  355
V 329    N  356
D 330    E  357
A 331    G  358
F 332    F  359
E 333    D  360
A 334    L  361
A 335    L  362
R 336    R  363
K 337    S  364
K 338    G  365
C 349    I  371
R 350    L  372
Q 351    T  373
G 352    F  374
TER
END


