
PFRMAT AL
TARGET T0112
AUTHOR 8734-6605-4366
METHOD Main features of the approach:
METHOD 1. Threading in an external energy field of 'the template results
METHOD    in an alignment of a target sequence on the template.
METHOD    The energy of the obtainedstructure is evaluated using
METHOD    phenomelogical potentials applied to Ca and Cb atoms.
METHOD 2. Averaging over homologs is used in energy calculations.
METHOD 3. "Fragmentation" gapless threading is used for the final
METHOD    selection of predictions
MODEL  1
PARENT 1sdg
M   1    K    5
A   2    P    6
S   3    A    7
D   4    A    8
N   5    E    9
L   6    N   10
S   7    L   11
A   8    S   12
V   9    L   13
L  10    V   14
Y  11    V   15
K  12    H   16
Q  13    G   17
N  14    P   18
D  15    G   19
L  16    D   20
Q  20    L   23
R  21    E   24
P  22    N   25
I  23    Y   26
P  24    P   27
E  25    I   28
P  26    P   29
K  27    E   30
E  28    P   31
D  29    G   32
E  30    P   33
V  31    N   34
L  32    E   35
L  33    V   36
Q  34    L   37
M  35    L   38
A  36    K   39
Y  37    M   40
V  38    H   41
G  39    S   42
I  40    V   43
C  41    G   44
G  42    I   45
S  43    C   46
D  44    G   47
Y  48    V   50
R  52    R   56
I  53    I   57
A  54    G   57B
D  55    D   57C
F  56    F   57D
I  57    V   58
V  58    V   59
K  59    K   60
D  60    K   61
P  61    P   62
M  62    M   63
V  63    V   64
I  64    L   65
G  65    G   66
H  66    H   67
E  67    E   68
A  68    A   69
S  69    S   70
G  70    G   71
T  71    T   72
V  72    V   73
V  73    V   74
K  74    K   75
V  75    V   76
G  76    G   77
K  77    S   78
N  78    L   79
V  79    V   80
K  80    R   81
H  81    H   82
L  82    L   83
K  83    Q   84
K  84    P   85
G  85    G   86
D  86    D   87
R  87    R   88
V  88    V   89
A  89    A   90
V  90    I   91
E  91    Q   92
P  92    P   93
G  93    G   94
V  94    A   95
P  95    P   96
C  96    R   97
R  97    Q   98
R  98    T   99
C  99    D  100
Q 100    E  101
F 101    F  102
C 102    C  103
K 103    K  104
E 104    I  105
G 105    G  106
K 106    R  107
Y 107    Y  108
N 108    N  109
L 109    L  110
C 110    S  111
P 111    P  112
D 112    T  113
L 113    I  114
T 114    F  115
F 115    F  116
C 116    C  117
A 117    A  118
T 118    T  139
P 119    P  140
P 120    P  141
D 121    D  142
D 122    D  143
G 123    G  144
N 124    N  145
L 125    L  146
A 126    C  147
R 127    R  148
Y 128    F  149
Y 129    Y  150
V 130    K  151
H 131    H  152
A 132    N  153
A 133    A  154
D 134    N  155
F 135    F  156
C 136    C  157
H 137    Y  158
K 138    K  159
L 139    L  160
P 140    P  161
D 141    D  162
N 142    N  163
V 143    V  164
S 144    T  165
L 145    F  166
E 146    E  167
E 147    E  168
G 148    G  169
A 149    A  170
L 150    L  171
L 151    I  172
E 152    E  174
P 153    P  175
L 154    L  176
S 155    S  177
V 156    V  178
G 157    G  179
V 158    I  180
H 159    H  182
A 160    A  183
C 161    C  184
R 162    R  185
R 163    R  186
A 164    A  187
G 165    G  188
V 166    V  189
Q 167    T  190
L 168    L  191
G 169    G  192
T 170    N  193
T 171    K  194
V 172    V  195
L 173    L  196
V 174    V  197
I 175    C  198
G 176    G  199
A 177    A  200
G 178    G  201
P 179    P  202
I 180    I  203
G 181    G  204
L 182    L  205
V 183    V  206
S 184    N  207
V 185    L  208
L 186    L  209
A 187    A  210
A 188    A  211
K 189    K  212
A 190    A  213
Y 191    M  214
G 192    G  215
A 193    A  216
F 194    A  217
V 195    Q  218
V 196    V  219
C 197    V  220
T 198    V  221
A 199    T  222
R 200    D  223
S 201    L  224
P 202    S  225
R 203    A  226
R 204    S  227
L 205    R  228
E 206    L  229
V 207    S  230
A 208    K  231
K 209    A  232
N 210    K  233
C 211    E  234
G 212    V  235
A 213    G  236
D 214    A  237
V 215    D  238
T 216    F  239
L 217    I  240
V 218    L  241
V 219    E  242
D 220    I  243
P 221    S  244
A 222    N  245
K 223    E  246
E 224    S  247
E 225    P  248
E 226    E  249
I 230    A  252
R 234    V  255
S 235    E  256
A 236    G  257
I 237    L  258
G 238    L  259
D 239    G  260
L 240    S  261
P 241    K  262
N 242    P  263
V 243    E  264
T 244    V  265
I 245    T  266
D 246    I  267
C 247    E  268
S 248    C  269
G 249    T  270
N 250    G  271
E 251    V  272
K 252    E  273
I 256    I  276
G 257    Q  277
I 258    A  278
N 259    G  279
I 260    I  280
T 261    Y  281
R 262    A  282
T 263    T  283
G 264    H  284
G 265    S  285
T 266    G  286
L 267    G  287
M 268    T  288
L 269    L  289
V 270    V  290
G 271    L  291
M 272    V  292
G 273    G  293
S 274    L  294
Q 275    G  295
M 276    S  296
V 277    E  297
T 278    M  298
V 279    T  299
P 280    S  302
L 281    V  304
V 282    P  305
N 283    L  307
A 284    V  308
C 285    H  309
A 286    A  310
R 287    A  311
E 288    T  313
I 289    R  314
D 290    E  315
I 291    V  316
K 292    D  317
S 293    I  318
V 294    K  319
F 295    G  320
R 296    V  321
Y 297    F  322
C 298    R  323
N 299    Y  324
D 300    C  325
Y 301    N  326
L 305    I  332
E 306    S  333
M 307    M  334
V 308    L  335
A 309    A  336
S 310    S  337
G 311    K  338
R 312    S  339
C 313    V  340
N 314    N  341
V 315    V  342
K 316    K  343
Q 317    P  344
L 318    L  345
V 319    V  346
T 320    T  347
H 321    H  348
S 322    R  349
F 323    F  350
K 324    P  351
L 325    L  352
E 326    E  353
Q 327    K  354
T 328    A  355
V 329    L  356
D 330    E  357
A 331    A  358
F 332    F  359
E 333    E  360
A 334    T  361
A 335    S  362
R 336    K  363
K 337    K  364
K 338    G  365
C 349    M  371
R 350    I  372
Q 351    K  373
G 352    C  374
TER
END


