
PFRMAT AL
TARGET T0112
AUTHOR 3092-8926-3558
METHOD PDB BLAST http://bioinformatics.ljcrf.edu/pdb_blast/
METHOD 1) Use PSI-Blast to collect homologs and create a sequence profile
METHOD    for the family.
METHOD 2) Use created profile to search for related proteins in PDB
MODEL  5
PARENT 3HUD_A
REMARK DATE	1994-01-31
REMARK SCORE	 1e-90	327	78/373 (20%)
L 6 K 10
S 7 A 11
A 8 A 12
V 9 V 13
L 10 L 14
Y 11 W 15
K 12 E 16
Q 13 K 18
N 14 K 19
D 15 P 20
L 16 F 21
R 17 S 22
L 18 I 23
E 19 E 24
Q 20 D 25
R 21 V 26
P 22 E 27
I 23 V 28
P 24 A 29
E 25 P 30
P 26 P 31
K 27 K 32
E 28 A 33
D 29 Y 34
E 30 E 35
V 31 V 36
L 32 R 37
L 33 I 38
Q 34 K 39
M 35 M 40
A 36 V 41
Y 37 A 42
V 38 V 43
G 39 G 44
I 40 I 45
C 41 C 46
G 42 R 47
S 43 T 48
D 44 D 49
V 45 D 50
H 46 H 51
Y 47 V 52
Y 48 V 53
E 49 S 54
H 50 G 55
G 51 N 56
R 52 L 57
I 53 V 58
A 54 T 59
D 55 P 60
D 60 L 61
P 61 P 62
M 62 V 63
V 63 I 64
I 64 L 65
G 65 G 66
H 66 H 67
E 67 E 68
A 68 A 69
S 69 A 70
G 70 G 71
T 71 I 72
V 72 V 73
V 73 E 74
K 74 S 75
V 75 V 76
G 76 G 77
K 77 E 78
N 78 G 79
V 79 V 80
K 80 T 81
H 81 T 82
L 82 V 83
K 83 K 84
K 84 P 85
G 85 G 86
D 86 D 87
R 87 K 88
V 88 V 89
A 89 I 90
V 90 P 91
E 91 L 92
P 92 F 93
G 93 T 94
V 94 P 95
P 95 Q 96
C 96 C 97
R 97 G 98
R 98 K 99
C 99 C 100
Q 100 R 101
F 101 V 102
C 102 C 103
K 103 K 104
E 104 N 105
G 105 P 106
K 106 E 107
Y 107 S 108
N 108 N 109
L 109 Y 110
C 110 C 111
P 111 L 112
D 112 K 113
L 113 N 114
T 114 D 115
F 115 L 116
C 116 I 137
A 117 H 138
T 118 H 139
P 119 F 140
P 120 L 141
D 121 G 142
D 122 T 143
G 123 S 144
N 124 T 145
L 125 F 146
A 126 S 147
R 127 Q 148
Y 128 Y 149
Y 129 T 150
V 130 V 151
H 131 V 152
A 132 D 153
A 133 E 154
D 134 N 155
F 135 A 156
C 136 V 157
H 137 A 158
K 138 K 159
L 139 I 160
P 140 D 161
D 141 A 162
N 142 A 163
V 143 S 164
S 144 P 165
L 145 L 166
E 146 E 167
E 147 K 168
G 148 V 169
A 149 C 170
L 150 L 171
L 151 I 172
E 152 G 173
P 153 C 174
L 154 G 175
S 155 T 178
V 156 G 179
G 157 Y 180
V 158 G 181
H 159 S 182
A 160 A 183
C 161 V 184
R 162 N 185
R 163 V 186
A 164 A 187
G 165 K 188
V 166 V 189
Q 167 T 190
L 168 P 191
G 169 G 192
T 170 S 193
T 171 T 194
V 172 C 195
L 173 A 196
V 174 V 197
I 175 F 198
G 176 G 199
A 177 L 200
G 178 G 201
P 179 G 202
I 180 V 203
G 181 G 204
L 182 L 205
V 183 S 206
S 184 A 207
V 185 V 208
L 186 M 209
A 187 G 210
A 188 C 211
K 189 K 212
A 190 A 213
Y 191 A 214
G 192 G 215
A 193 A 217
F 194 R 218
V 195 I 219
V 196 I 220
C 197 A 221
T 198 V 222
A 199 D 223
R 200 I 224
S 201 N 225
P 202 K 226
R 203 D 227
R 204 K 228
L 205 F 229
E 206 A 230
V 207 K 231
A 208 A 232
K 209 K 233
N 210 E 234
C 211 L 235
G 212 G 236
A 213 A 237
T 216 T 238
L 217 E 239
V 218 C 240
V 219 I 241
D 220 N 242
P 221 P 243
A 222 Q 244
K 223 D 245
E 224 Y 246
E 225 K 247
S 227 K 248
S 228 P 249
I 229 I 250
I 230 Q 251
E 231 E 252
R 232 V 253
I 233 L 254
R 234 K 255
S 235 E 256
A 236 M 257
I 237 T 258
G 238 D 259
D 239 G 260
L 240 G 261
P 241 V 262
N 242 D 263
V 243 F 264
T 244 S 265
I 245 F 266
D 246 E 267
C 247 V 268
S 248 I 269
G 249 G 270
N 250 R 271
E 251 L 272
K 252 D 273
C 253 T 274
I 254 M 275
T 255 M 276
I 256 A 277
G 257 S 278
I 258 L 279
N 259 L 280
I 260 C 281
T 261 C 282
R 262 H 283
T 263 A 285
G 264 C 286
G 265 G 287
T 266 T 288
L 267 S 289
M 268 V 290
L 269 I 291
V 270 V 292
G 271 G 293
M 272 V 294
G 273 P 295
S 274 P 296
Q 275 A 297
M 276 S 298
V 277 N 304
T 278 P 305
V 279 M 306
P 280 L 307
L 281 L 308
V 282 L 309
N 283 T 310
A 284 G 311
C 285 R 312
A 286 T 313
R 287 W 314
E 288 K 315
I 289 G 316
D 290 A 317
I 291 V 318
K 292 Y 319
S 293 G 320
V 294 G 321
F 295 F 322
R 296 K 323
Y 297 S 324
C 298 K 325
N 299 E 326
D 300 G 327
Y 301 I 328
P 302 P 329
I 303 K 330
A 304 L 331
L 305 V 332
E 306 A 333
M 307 D 334
V 308 F 335
A 309 M 336
S 310 A 337
G 311 K 338
R 312 K 339
C 313 F 340
N 314 S 341
V 315 L 342
K 316 D 343
Q 317 A 344
L 318 L 345
V 319 I 346
T 320 T 347
H 321 H 348
S 322 V 349
F 323 L 350
K 324 P 351
L 325 F 352
E 326 E 353
Q 327 K 354
T 328 I 355
V 329 N 356
D 330 E 357
A 331 G 358
F 332 F 359
E 333 D 360
A 334 L 361
A 335 L 362
R 336 H 363
K 337 S 364
K 338 G 365
A 339 K 366
T 342 S 367
I 343 I 368
K 344 R 369
V 345 T 370
M 346 V 371
I 347 L 372
S 348 T 373
TER
END

