
PFRMAT AL
TARGET T0112
AUTHOR 3359-3308-3659
REMARK FUGUE AUTOMATIC ALIGNMENT
REMARK ZSCORE=60.39
REMARK CONFIDENCE: CERTAIN   (99% confidence [ ZSCORE>=6.0 ])
REMARK DERIVED FROM HOMSTRAD PROFILE: adh
METHOD Environment-specific substitution tables were derived from the structure-based
METHOD alignments in the HOMSTRAD database. Each alignment in HOMSTRAD was converted
METHOD into a scoring template (profile) using the environment-specific substitution 
METHOD tables and structure-dependent gap penalties. The program FUGUE searches
METHOD a sequence or sequence alignment against the library of profiles.
MODEL  1
PARENT 1d1t_A
M   1     K     5
A   2     V     6
S   3     I     7
D   4     K     8
N   5     C     9
L   6     K    10
S   7     A    11
A   8     A    12
V   9     V    13
L  10     L    14
Y  11     W    15
K  12     E    16
Q  13     Q    17
N  14     K    18
D  15     P    20
L  16     F    21
R  17     S    22
L  18     I    23
E  19     E    24
Q  20     E    25
R  21     I    26
P  22     E    27
I  23     V    28
P  24     A    29
E  25     P    30
P  26     P    31
K  27     K    32
E  28     T    33
D  29     K    34
E  30     E    35
V  31     V    36
L  32     R    37
L  33     I    38
Q  34     K    39
M  35     I    40
A  36     L    41
Y  37     A    42
V  38     T    43
G  39     G    44
I  40     I    45
C  41     C    46
G  42     R    47
S  43     T    48
D  44     D    49
V  45     D    50
H  46     H    51
Y  47     V    52
Y  48     I    53
E  49     K    54
H  50     G    55
G  51     T    56
F  56     M    57
I  57     V    58
V  58     S    59
K  59     K    60
D  60     F    61
P  61     P    62
M  62     V    63
V  63     I    64
I  64     V    65
G  65     G    66
H  66     H    67
E  67     E    68
A  68     A    69
S  69     T    70
G  70     G    71
T  71     I    72
V  72     V    73
V  73     E    74
K  74     S    75
V  75     I    76
G  76     G    77
K  77     E    78
N  78     G    79
V  79     V    80
K  80     T    81
H  81     T    82
L  82     V    83
K  83     K    84
K  84     P    85
G  85     G    86
D  86     D    87
R  87     K    88
V  88     V    89
A  89     I    90
V  90     P    91
E  91     L    92
P  92     F    93
G  93     L    94
V  94     P    95
P  95     Q    96
C  96     C    97
R  97     R    98
R  98     E    99
C  99     C   100
Q 100     N   101
F 101     A   102
C 102     C   103
K 103     R   104
E 104     N   105
G 105     P   106
K 106     D   107
Y 107     G   108
N 108     N   109
L 109     L   110
C 110     C   111
P 111     I   112
D 112     R   113
L 113     F   130
T 114     T   131
F 115     C   132
C 116     K   133
A 117     G   134
T 118     K   135
P 119     P   136
P 120     V   137
D 121     H   138
D 122     H   139
G 123     S   144
N 124     T   145
L 125     F   146
A 126     T   147
R 127     E   148
Y 128     Y   149
Y 129     T   150
V 130     V   151
H 131     V   152
A 132     D   153
A 133     E   154
D 134     S   155
F 135     S   156
C 136     V   157
H 137     A   158
K 138     K   159
L 139     I   160
P 140     D   161
D 141     D   162
N 142     A   163
V 143     A   164
S 144     P   165
L 145     P   166
E 146     E   167
E 147     K   168
G 148     V   169
A 149     C   170
L 150     L   171
L 151     I   172
E 152     G   173
P 153     C   174
L 154     F   176
S 155     S   177
V 156     T   178
G 157     G   179
V 158     Y   180
H 159     G   181
A 160     A   182
C 161     A   183
R 162     K   185
R 163     T   186
A 164     G   187
G 165     K   188
V 166     V   189
Q 167     K   190
L 168     P   191
G 169     G   192
T 170     S   193
T 171     T   194
V 172     C   195
L 173     V   196
V 174     V   197
I 175     F   198
G 176     G   199
A 177     L   200
G 178     G   201
P 179     G   202
I 180     V   203
G 181     G   204
L 182     L   205
V 183     S   206
S 184     V   207
V 185     I   208
L 186     M   209
A 187     G   210
A 188     C   211
K 189     K   212
A 190     S   213
Y 191     A   214
G 192     G   215
A 193     A   216
F 194     R   218
V 195     I   219
V 196     I   220
C 197     G   221
T 198     I   222
A 199     D   223
R 200     L   224
S 201     N   225
P 202     K   226
R 203     D   227
R 204     K   228
L 205     F   229
E 206     E   230
V 207     K   231
A 208     A   232
K 209     M   233
N 210     A   234
C 211     V   235
G 212     G   236
A 213     A   237
T 216     T   238
L 217     E   239
V 218     C   240
V 219     I   241
D 220     S   242
P 221     P   243
A 222     K   244
K 223     D   245
E 225     S   246
E 226     T   247
S 227     K   248
S 228     P   249
I 229     I   250
I 230     S   251
E 231     E   252
R 232     V   253
I 233     L   254
R 234     S   255
S 235     E   256
A 236     M   257
I 237     T   258
G 238     G   259
D 239     N   260
L 240     N   261
P 241     V   262
N 242     G   263
V 243     Y   264
T 244     T   265
I 245     F   266
D 246     E   267
C 247     V   268
S 248     I   269
G 249     G   270
N 250     H   271
E 251     L   272
K 252     E   273
C 253     T   274
I 254     M   275
T 255     I   276
I 256     D   277
G 257     A   278
I 258     L   279
N 259     A   280
I 260     S   281
T 261     C   282
R 262     H   283
T 263     M   284
G 264     N   285
G 265     G   287
T 266     T   288
L 267     S   289
M 268     V   290
L 269     V   291
V 270     V   292
G 271     G   293
M 272     V   294
G 273     P   295
S 274     P   296
Q 275     T   302
M 276     Y   303
V 277     D   304
T 278     P   305
V 279     M   306
P 280     L   307
L 281     L   308
V 282     F   309
N 283     T   310
A 284     G   311
C 285     R   312
A 286     T   313
R 287     W   314
E 288     K   315
I 289     G   316
D 290     C   317
I 291     V   318
K 292     F   319
S 293     G   320
V 294     G   321
F 295     L   322
R 296     K   323
Y 297     S   324
C 298     R   325
N 299     D   326
D 300     D   327
Y 301     V   328
P 302     P   329
I 303     K   330
A 304     L   331
L 305     V   332
E 306     T   333
M 307     E   334
V 308     F   335
A 309     L   336
S 310     A   337
G 311     K   338
R 312     K   339
C 313     F   340
N 314     D   341
V 315     L   342
K 316     D   343
Q 317     Q   344
L 318     L   345
V 319     I   346
T 320     T   347
H 321     H   348
S 322     V   349
F 323     L   350
K 324     P   351
L 325     F   352
E 326     K   353
Q 327     K   354
T 328     I   355
V 329     S   356
D 330     E   357
A 331     G   358
F 332     F   359
E 333     E   360
A 334     L   361
A 335     L   362
R 336     N   363
K 337     S   364
D 340     G   365
N 341     Q   366
T 342     S   367
I 343     I   368
K 344     R   369
V 345     T   370
M 346     V   371
I 347     L   372
S 348     T   373
C 349     F   374
TER
END

