
PFRMAT AL
TARGET T0100
AUTHOR 8971-8833-9593
METHOD FFAS (http://bioinformatics.burnham-inst.org/FFAS/)
METHOD Fold & Function Assignment System A profile-profile alignment method.
METHOD 1) PSI-Blast is used to collect homologs
METHOD 2) The sequences of homologs are translated into a profile
METHOD    [The translation is not based on PSI-Blast approach]
METHOD 3) Translated profile is aligned against a profile database
MODEL  1
PARENT 1pcl
N 29 T 18
A 30 T 19
V 31 G 20
V 32 G 21
S 33 A 22
K 34 K 23
S 35 A 24
S 36 A 25
S 37 K 26
D 38 A 27
G 39 V 28
T 41 E 29
F 42 V 30
K 43 K 31
T 44 N 32
I 45 I 33
A 46 S 34
D 47 D 35
A 48 F 36
I 49 K 37
A 50 K 38
S 51 A 39
A 52 L 40
P 53 N 41
A 54 T 43
G 55 D 44
S 56 S 45
T 57 S 46
P 58 A 47
F 59 K 48
V 60 I 49
I 61 I 50
V 67 K 51
Y 68 V 52
N 69 T 53
E 70 G 54
R 71 P 55
L 72 I 56
T 73 D 57
I 74 I 58
T 75 S 59
R 76 G 60
N 77 G 61
N 78 K 62
L 79 A 63
H 80 Y 64
L 81 T 65
K 82 S 66
G 83 F 67
E 84 D 68
S 85 A 72
R 86 R 73
N 87 S 74
G 88 Q 75
A 89 I 76
V 90 S 77
I 91 I 78
A 92 P 79
A 93 S 80
A 94 N 81
T 95 T 82
A 96 T 83
A 97 I 84
G 98 I 85
T 99 G 86
L 100 V 87
K 101 G 88
S 102 S 89
D 103 N 90
G 104 G 91
S 105 K 92
K 106 F 93
W 107 T 94
G 108 N 95
T 109 G 96
A 110 S 97
G 111 L 98
I 115 V 99
T 116 I 100
I 117 K 101
S 118 G 102
A 119 V 103
K 120 K 104
D 121 N 105
F 122 V 106
S 123 I 107
A 124 L 108
Q 125 R 109
S 126 N 110
L 127 L 111
T 128 Y 112
I 129 I 113
R 130 E 114
N 131 T 115
D 132 P 116
F 133 V 117
D 134 D 118
F 135 V 119
P 136 A 120
A 137 P 121
N 138 H 122
D 145 E 124
S 146 S 125
S 147 G 126
K 148 D 127
I 149 G 128
K 150 W 129
D 151 N 130
T 152 A 131
Q 153 E 132
A 154 W 133
V 155 D 134
A 156 A 135
L 157 A 136
Y 158 V 137
V 159 I 138
T 160 D 139
K 161 N 140
S 162 S 141
G 163 T 142
D 164 D 147
R 165 H 148
A 166 V 149
Y 167 T 150
F 168 I 151
K 169 S 152
D 170 D 153
V 171 G 154
S 172 S 155
L 173 H 172
V 174 D 173
G 175 G 174
Y 176 A 175
Q 177 L 176
D 178 D 177
L 180 I 178
Y 181 K 179
V 182 K 180
S 183 G 181
G 184 S 182
G 185 D 183
R 186 Y 184
S 187 V 185
F 188 T 186
F 189 I 187
S 190 S 188
D 191 Y 189
C 192 S 190
R 193 R 191
I 194 F 192
S 195 E 193
G 196 G 202
T 197 H 203
V 198 S 204
D 199 D 205
G 203 G 213
D 204 K 214
G 205 L 215
T 206 R 216
A 207 V 217
L 208 T 218
F 209 F 219
N 210 H 220
N 211 N 221
D 213 R 226
L 214 V 227
V 215 T 228
S 216 E 229
R 217 R 230
Y 218 A 231
R 219 P 232
A 220 R 233
D 221 V 234
K 223 R 235
S 224 F 236
G 225 G 237
N 226 S 238
V 227 I 239
S 228 H 240
G 229 A 241
Y 230 Y 242
L 231 L 263
T 232 G 264
A 233 T 265
P 234 S 266
S 235 G 267
T 236 S 268
N 237 I 269
I 238 L 270
N 239 S 271
Q 240 E 272
K 241 S 273
Y 242 N 274
G 243 S 275
L 244 F 276
V 245 T 277
I 246 L 278
T 247 S 279
N 248 N 280
S 249 K 282
R 250 S 283
V 251 I 284
I 252 D 285
R 253 G 286
E 254 K 287
S 255 N 288
D 256 P 289
S 257 E 290
V 258 C 291
P 259 S 292
A 260 I 293
K 261 V 294
S 262 K 295
Y 263 Q 296
G 264 F 297
L 265 N 298
G 266 S 299
T 289 K 300
V 290 V 301
F 291 F 302
T 294 S 303
S 295 D 304
M 296 K 305
D 297 G 306
N 298 S 307
H 299 L 308
I 300 V 309
Y 301 N 310
G 302 G 311
W 303 S 312
D 304 T 313
K 305 T 314
M 306 T 315
S 307 K 316
G 308 L 317
K 309 D 318
D 310 T 319
K 311 C 320
N 312 G 321
G 313 L 322
N 314 T 323
T 315 A 324
Y 328 Y 325
K 329 K 326
S 330 P 327
Y 331 T 328
G 332 L 329
A 333 P 330
G 334 Y 331
A 335 K 332
A 336 Y 333
V 337 S 334
S 338 A 335
K 339 Q 336
D 340 T 337
R 341 M 338
R 342 T 339
D 346 S 340
A 347 S 341
Q 348 L 342
A 349 A 343
A 350 T 344
E 351 S 345
Y 352 I 346
T 353 N 347
Q 354 N 348
S 355 N 349
K 356 A 350
V 357 G 351
L 358 Y 352
G 359 G 353
TER
END

