
PFRMAT AL
TARGET T0100
AUTHOR 1205-3016-5241
METHOD SENSER identified a relationship between the target and
METHOD pectate lyase in the trailing end searches. An alignment
METHOD was automatically generated with HMMer using profiles
METHOD of the target and pdb families.
MODEL 1
PARENT 1pcl
A  25    D  69
T  26    Q  70
T  27    K  71
Y  28    A  72
N  29    R  73
A  30    S  74
V  31    Q  75
L  72    I  76
T  73    S  77
I  74    I  78
T  75    P  79
R  76    S  80
N  77    N  81
H  80    T  83
L  81    I  84
K  82    I  85
G  83    G  86
E  84    V  87
S  85    G  88
R  86    S  89
N  87    N  90
G  88    G  91
A  89    K  92
V  90    F  93
I  91    T  94
A  92    N  95
A  93    G  96
A  94    S  97
T  95    L  98
A  97    V  99
G  98    I 100
S 105    K 101
K 106    G 102
W 107    V 103
G 108    K 104
D 121    N 105
F 122    V 106
S 123    I 107
A 124    L 108
Q 125    R 109
S 126    N 110
L 127    L 111
T 128    Y 112
I 129    I 113
N 138    E 114
Q 139    T 115
A 140    P 116
K 141    V 117
S 142    D 118
D 143    V 119
S 144    A 120
D 145    P 121
S 146    N 140
S 147    S 141
K 148    T 142
R 165    N 143
A 166    V 144
Y 167    W 145
F 168    V 146
K 169    D 147
D 170    H 148
V 171    V 149
S 172    T 150
L 173    I 151
V 174    S 152
G 175    D 153
Y 176    G 154
Q 177    E 167
D 178    K 168
T 179    Y 169
L 180    V 170
Y 181    Q 171
V 182    H 172
S 183    D 173
G 184    G 174
G 185    A 175
R 186    K 197
S 187    T 198
F 188    I 199
F 189    L 200
S 190    I 201
D 191    G 202
C 192    H 203
R 193    S 204
I 194    D 205
S 195    S 206
N 226    L 258
V 227    Y 259
S 228    S 260
G 229    F 261
A 233    G 262
P 234    L 263
S 235    G 264
T 236    T 265
N 237    S 266
I 238    G 267
N 239    S 268
L 244    I 269
V 245    L 270
I 246    S 271
T 247    E 272
N 248    S 273
S 249    N 274
R 250    S 275
V 251    F 276
I 252    T 277
R 253    L 278
E 254    S 279
S 255    N 280
D 256    L 281
S 257    K 282
V 258    S 283
P 259    I 284
A 260    D 285
T 272    G 286
T 273    K 287
T 274    N 288
F 275    P 289
S 276    E 290
D 277    C 291
G 278    S 292
R 279    I 293
Y 280    S 299
A 281    K 300
D 282    V 301
P 283    F 302
N 284    S 303
A 285    D 304
D 297    K 305
N 298    G 306
H 299    S 307
I 300    L 308
Y 301    V 309
S 307    N 310
G 308    G 311
K 309    S 312
D 310    T 313
F 318    T 314
N 319    T 315
P 320    K 316
E 321    L 317
D 322    D 318
A 336    L 322
V 337    T 323
S 338    A 324
K 339    Y 325
T 345    K 326
D 346    P 327
A 347    T 328
Q 348    L 329
A 349    P 330
A 350    Y 331
E 351    K 332
Y 352    Y 333
T 353    S 334
Q 354    A 335
S 355    Q 336
K 356    T 337
V 357    M 338
L 358    T 339
G 359    S 340
D 360    S 341
T 362    T 344
P 363    S 345
T 364    I 346
L 365    N 347
P 366    N 348
TER
END



