
PFRMAT AL
TARGET T0100
AUTHOR 3092-8926-3558
METHOD PDB BLAST http://bioinformatics.ljcrf.edu/pdb_blast/
METHOD 1) Use PSI-Blast to collect homologs and create a sequence profile
METHOD    for the family.
METHOD 2) Use created profile to search for related proteins in PDB
MODEL  2
PARENT 1iiv_B
N 78 N 206
L 79 A 207
H 80 R 208
L 81 L 209
K 82 Y 210
G 83 G 211
E 84 N 212
S 85 G 213
R 86 D 214
N 87 R 215
G 88 A 216
A 89 T 217
V 90 V 218
I 91 Y 219
A 92 T 220
A 93 G 221
A 94 G 222
T 95 L 223
A 96 K 224
A 97 Y 225
G 98 D 226
T 99 A 227
L 100 N 228
K 101 N 229
S 102 I 230
D 103 Y 231
G 104 A 233
S 105 A 234
K 106 Q 235
W 107 Y 236
G 108 S 237
T 109 Q 238
A 110 T 239
G 111 Y 240
S 112 N 241
S 113 A 242
T 114 T 243
I 115 R 244
T 116 F 245
I 117 G 246
S 118 T 247
A 119 S 248
K 120 N 249
D 121 G 250
F 122 S 251
S 123 N 252
A 124 S 254
Q 125 T 255
S 126 S 256
L 127 Y 257
T 128 G 258
I 129 F 259
R 130 A 260
N 131 N 261
D 132 K 262
F 133 A 263
D 134 Q 264
F 135 N 265
P 136 F 266
A 137 E 267
N 138 V 268
Q 139 V 269
A 140 A 270
K 141 Q 271
S 142 Y 272
D 143 Q 273
S 144 F 274
D 145 D 275
S 146 F 276
S 147 G 277
K 148 L 278
T 152 R 279
Q 153 P 280
A 154 S 281
V 155 V 282
A 156 A 283
L 157 Y 284
Y 158 L 285
V 159 Q 286
T 160 S 287
K 161 K 288
S 162 G 289
G 163 K 290
D 164 D 291
R 165 I 292
A 166 S 293
Y 167 N 294
F 168 G 295
K 169 Y 296
D 170 G 297
V 171 A 298
S 172 S 299
V 174 Y 300
G 175 G 301
Y 176 D 302
Q 177 Q 303
D 178 D 304
T 179 I 305
L 180 V 306
Y 181 Y 308
V 182 V 309
S 183 D 310
G 184 V 311
G 185 G 312
R 186 A 313
S 187 T 314
F 188 Y 315
F 189 Y 316
S 190 F 317
D 191 N 318
C 192 K 319
R 193 N 320
I 194 M 321
S 195 S 322
G 196 T 323
T 197 Y 324
V 198 V 325
D 199 D 326
F 200 Y 327
TER
END

