
PFRMAT AL
TARGET T0087
AUTHOR 8971-8833-9593
METHOD FFAS (http://bioinformatics.burnham-inst.org/FFAS/)
METHOD Fold & Function Assignment System A profile-profile alignment method.
METHOD 1) PSI-Blast is used to collect homologs
METHOD 2) The sequences of homologs are translated into a profile
METHOD    [The translation is not based on PSI-Blast approach]
METHOD 3) Translated profile is aligned against a profile database
MODEL  5
PARENT 1CYG
REMARK DATE	1995-02-28
REMARK SCORE	?
S 2 D 155
K 3 N 156
I 4 G 157
L 5 T 158
V 6 L 159
F 7 L 160
G 8 G 161
H 9 G 162
Q 10 Y 163
N 11 T 164
P 12 N 165
D 13 D 166
S 14 A 167
D 15 N 168
A 16 M 169
I 17 Y 170
G 18 F 171
S 19 H 172
S 20 H 173
M 21 N 174
A 22 G 175
Y 23 G 176
A 24 T 177
Y 25 T 178
L 26 F 179
K 27 S 180
R 28 S 181
Q 29 L 182
L 30 E 183
G 31 G 185
V 32 I 186
D 33 Y 187
A 34 R 188
Q 35 N 189
A 36 L 190
V 37 F 191
A 38 D 192
L 39 L 193
G 40 A 194
N 41 D 195
P 42 L 196
N 43 N 197
E 44 H 198
E 45 Q 199
T 46 N 200
A 47 P 201
F 48 V 202
V 49 I 203
L 50 D 204
D 51 R 205
Y 52 Y 206
F 53 L 207
G 54 K 208
I 55 D 209
Q 56 A 210
A 57 V 211
P 58 K 212
P 59 M 213
V 60 W 214
V 61 I 215
K 62 D 216
S 63 M 217
A 64 I 219
Q 65 D 220
A 66 G 221
E 67 I 222
G 68 R 223
A 69 M 224
K 70 D 225
Q 71 A 226
V 72 V 227
I 73 K 228
L 74 H 229
T 75 M 230
D 76 P 231
H 77 F 232
N 78 G 233
E 79 W 234
F 80 Q 235
Q 81 K 236
Q 82 S 237
S 83 L 238
I 84 M 239
A 85 D 240
D 86 E 241
I 87 I 242
R 88 D 243
E 89 N 244
V 90 Y 245
E 91 R 246
V 92 P 247
V 93 V 248
E 94 T 250
V 95 F 251
V 96 G 252
D 97 E 253
H 98 W 254
H 99 F 255
R 100 L 256
V 101 S 257
A 102 E 258
N 103 N 259
F 104 E 260
E 105 V 261
T 106 D 262
A 107 A 263
N 108 N 264
P 109 N 265
L 110 H 266
Y 111 Y 267
M 112 F 268
R 113 A 269
L 114 N 270
E 115 E 271
P 116 S 272
V 117 G 273
G 118 M 274
S 119 S 275
A 120 L 276
S 121 L 277
S 122 D 278
I 123 F 279
V 124 G 282
Y 125 Q 283
R 126 K 284
L 127 L 285
Y 128 R 286
K 129 Q 287
E 130 V 288
N 131 L 289
G 132 N 291
V 133 N 292
A 134 S 293
I 135 D 294
P 136 N 295
K 137 W 296
E 138 Y 297
I 139 G 298
A 140 F 299
G 141 N 300
V 142 Q 301
M 143 M 302
L 144 I 303
S 145 Q 304
G 146 D 305
L 147 T 306
I 148 A 307
S 149 S 308
D 150 D 324
T 151 M 325
L 152 D 326
L 153 R 327
L 154 F 328
K 155 M 329
S 156 I 330
P 157 D 331
T 158 G 332
T 159 G 333
H 160 D 334
A 161 P 335
S 162 R 336
D 163 K 337
P 164 V 338
A 165 D 339
V 166 M 340
A 167 A 341
E 168 A 343
D 169 V 344
L 170 L 345
A 171 L 346
K 172 T 347
I 173 S 348
A 174 R 349
G 175 G 350
V 176 V 351
D 177 P 352
L 178 N 353
Q 179 I 354
E 180 Y 355
Y 181 Y 356
G 182 G 357
L 183 T 358
A 184 E 359
M 185 Q 360
L 186 N 369
K 187 N 370
A 188 R 371
G 189 K 372
T 190 M 373
N 191 M 374
L 192 S 375
A 193 S 376
S 194 F 377
K 195 N 378
T 196 K 379
A 197 N 380
A 198 T 381
Q 199 R 382
L 200 A 383
V 201 Y 384
D 202 Q 385
I 203 V 386
D 204 I 387
A 205 Q 388
K 206 K 389
T 207 L 390
F 208 S 391
E 209 S 392
L 210 L 393
N 211 R 394
G 212 R 395
S 213 N 396
Q 214 N 397
V 215 P 398
R 216 A 399
V 217 L 400
A 218 A 401
Q 219 Y 402
V 220 G 403
N 221 D 404
T 222 T 405
V 223 E 406
D 224 Q 407
I 225 R 408
N 226 W 409
E 227 I 410
V 228 V 416
L 229 Y 417
E 230 E 418
R 231 R 419
Q 232 Q 420
N 233 F 421
E 234 G 422
I 235 K 423
E 236 D 424
E 237 V 425
A 238 V 426
I 239 L 427
K 240 V 428
A 241 A 429
S 242 V 430
Q 243 N 431
A 244 R 432
A 245 S 433
N 246 S 434
G 247 S 435
Y 248 S 436
S 249 N 437
D 250 Y 438
F 251 S 439
V 252 I 440
L 253 T 441
M 254 G 442
I 255 L 443
T 256 F 444
D 257 T 445
I 258 A 446
L 259 L 447
N 260 P 448
S 261 A 449
N 262 G 450
S 263 T 451
E 264 Y 452
I 265 T 453
L 266 D 454
A 267 Q 455
L 268 L 456
G 269 G 457
N 270 G 458
N 271 L 459
T 272 G 462
D 273 N 463
TER
END

